MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium phaeovibrioides DSM 265 chromosome

Total Repeats: 40939

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009337	AGG	2	6	41	46	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145218823
2	NC_009337	AGC	2	6	71	76	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145218823
3	NC_009337	G	8	8	171	178	0 %	0 %	100 %	0 %	145218823
4	NC_009337	T	8	8	204	211	0 %	100 %	0 %	0 %	145218823
5	NC_009337	GAA	2	6	223	228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145218823
6	NC_009337	ACT	2	6	230	235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145218823
7	NC_009337	CAGC	2	8	354	361	25 %	0 %	25 %	50 %	145218823
8	NC_009337	AGA	2	6	378	383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145218823
9	NC_009337	A	6	6	391	396	100 %	0 %	0 %	0 %	145218823
10	NC_009337	TCA	2	6	397	402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145218823
11	NC_009337	GA	4	8	412	419	50 %	0 %	50 %	0 %	145218823
12	NC_009337	GTG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145218823
13	NC_009337	CT	3	6	489	494	0 %	50 %	0 %	50 %	145218823
14	NC_009337	GCC	3	9	502	510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145218823
15	NC_009337	G	7	7	565	571	0 %	0 %	100 %	0 %	145218823
16	NC_009337	ATG	2	6	592	597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145218823
17	NC_009337	TCG	2	6	718	723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145218823
18	NC_009337	GAAAA	2	10	776	785	80 %	0 %	20 %	0 %	145218823
19	NC_009337	A	6	6	782	787	100 %	0 %	0 %	0 %	145218823
20	NC_009337	AGG	2	6	791	796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145218823
21	NC_009337	CAAA	2	8	830	837	75 %	0 %	0 %	25 %	145218823
22	NC_009337	ATT	2	6	841	846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145218823
23	NC_009337	CCG	2	6	851	856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145218823
24	NC_009337	GCC	2	6	936	941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145218823
25	NC_009337	CAG	2	6	982	987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145218823
26	NC_009337	TGA	2	6	1002	1007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145218823
27	NC_009337	CAA	2	6	1029	1034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145218823
28	NC_009337	CTT	2	6	1078	1083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145218823
29	NC_009337	GCC	2	6	1084	1089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145218823
30	NC_009337	CT	3	6	1117	1122	0 %	50 %	0 %	50 %	145218823
31	NC_009337	AAC	2	6	1166	1171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145218823
32	NC_009337	AAC	2	6	1295	1300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145218823
33	NC_009337	ATC	2	6	1308	1313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145218823
34	NC_009337	GGA	2	6	1339	1344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145218823
35	NC_009337	TCAT	2	8	1361	1368	25 %	50 %	0 %	25 %	145218823
36	NC_009337	AAG	2	6	1434	1439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145218823
37	NC_009337	GAGAAA	2	12	1537	1548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009337	CAA	2	6	1555	1560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009337	ACC	2	6	1561	1566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_009337	GTA	2	6	1582	1587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009337	GAA	2	6	1608	1613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009337	A	6	6	1615	1620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009337	TAAA	2	8	1636	1643	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009337	AG	4	8	1659	1666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009337	TGT	2	6	1671	1676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009337	CT	3	6	1690	1695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009337	CAA	3	9	1700	1708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009337	CCT	2	6	1760	1765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145218824
49	NC_009337	AGC	2	6	1772	1777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145218824
50	NC_009337	CATC	2	8	1845	1852	25 %	25 %	0 %	50 %	145218824
51	NC_009337	TC	3	6	1851	1856	0 %	50 %	0 %	50 %	145218824
52	NC_009337	T	7	7	1878	1884	0 %	100 %	0 %	0 %	145218824
53	NC_009337	CGAAG	2	10	1915	1924	40 %	0 %	40 %	20 %	145218824
54	NC_009337	GTAT	2	8	1988	1995	25 %	50 %	25 %	0 %	145218824
55	NC_009337	TC	3	6	2135	2140	0 %	50 %	0 %	50 %	145218824
56	NC_009337	CAT	2	6	2169	2174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145218824
57	NC_009337	AAC	2	6	2181	2186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145218824
58	NC_009337	TGCA	2	8	2190	2197	25 %	25 %	25 %	25 %	145218824
59	NC_009337	ATG	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145218824
60	NC_009337	TCT	2	6	2253	2258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145218824
61	NC_009337	TC	3	6	2311	2316	0 %	50 %	0 %	50 %	145218824
62	NC_009337	TTG	2	6	2339	2344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145218824
63	NC_009337	TTCC	2	8	2345	2352	0 %	50 %	0 %	50 %	145218824
64	NC_009337	CAGA	2	8	2383	2390	50 %	0 %	25 %	25 %	145218824
65	NC_009337	TGAGAG	2	12	2409	2420	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	145218824
66	NC_009337	TCA	2	6	2468	2473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145218824
67	NC_009337	AGC	2	6	2522	2527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145218824
68	NC_009337	TCA	3	9	2528	2536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145218824
69	NC_009337	GAG	2	6	2668	2673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145218824
70	NC_009337	TGA	2	6	2751	2756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145218824
71	NC_009337	ACC	2	6	2788	2793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145218824
72	NC_009337	GAA	2	6	2818	2823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145218824
73	NC_009337	A	6	6	2822	2827	100 %	0 %	0 %	0 %	145218824
74	NC_009337	TCA	2	6	2837	2842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145218824
75	NC_009337	CAA	2	6	2865	2870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145218824
76	NC_009337	T	6	6	2938	2943	0 %	100 %	0 %	0 %	145218825
77	NC_009337	AATC	2	8	3013	3020	50 %	25 %	0 %	25 %	145218825
78	NC_009337	AG	3	6	3211	3216	50 %	0 %	50 %	0 %	145218825
79	NC_009337	AAG	2	6	3221	3226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145218825
80	NC_009337	C	7	7	3297	3303	0 %	0 %	0 %	100 %	145218825
81	NC_009337	TCC	2	6	3325	3330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145218825
82	NC_009337	TCT	2	6	3394	3399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145218825
83	NC_009337	TGC	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145218825
84	NC_009337	CAG	2	6	3440	3445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145218825
85	NC_009337	TGC	2	6	3477	3482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145218825
86	NC_009337	CTT	2	6	3504	3509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145218825
87	NC_009337	CAG	2	6	3510	3515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145218825
88	NC_009337	GGT	2	6	3593	3598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145218825
89	NC_009337	TTC	2	6	3678	3683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145218825
90	NC_009337	GAAC	2	8	3697	3704	50 %	0 %	25 %	25 %	145218825
91	NC_009337	TTC	2	6	3714	3719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145218825
92	NC_009337	TCTT	2	8	3759	3766	0 %	75 %	0 %	25 %	145218825
93	NC_009337	GCA	2	6	3805	3810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145218825
94	NC_009337	A	6	6	3861	3866	100 %	0 %	0 %	0 %	145218825
95	NC_009337	TCT	2	6	3886	3891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145218825
96	NC_009337	TGA	2	6	3892	3897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145218825
97	NC_009337	TTC	2	6	3973	3978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145218825
98	NC_009337	CAG	2	6	4005	4010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145218825
99	NC_009337	CCA	2	6	4012	4017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145218825
100	NC_009337	GAC	2	6	4024	4029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145218825
101	NC_009337	A	6	6	4081	4086	100 %	0 %	0 %	0 %	145218826
102	NC_009337	TTC	2	6	4089	4094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145218826
103	NC_009337	TGA	2	6	4128	4133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145218826
104	NC_009337	CAC	2	6	4200	4205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145218826
105	NC_009337	TTG	2	6	4232	4237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145218826
106	NC_009337	GAACT	2	10	4267	4276	40 %	20 %	20 %	20 %	145218826
107	NC_009337	CATC	2	8	4286	4293	25 %	25 %	0 %	50 %	145218826
108	NC_009337	CAC	2	6	4322	4327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145218826
109	NC_009337	CAT	2	6	4350	4355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145218826
110	NC_009337	TCCT	2	8	4396	4403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009337	TTCG	2	8	4468	4475	0 %	50 %	25 %	25 %	145218827
112	NC_009337	TTC	2	6	4757	4762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145218827
113	NC_009337	GA	3	6	4941	4946	50 %	0 %	50 %	0 %	145218827
114	NC_009337	T	6	6	4955	4960	0 %	100 %	0 %	0 %	145218827
115	NC_009337	ATA	2	6	5078	5083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145218827
116	NC_009337	CAT	2	6	5092	5097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145218827
117	NC_009337	TCG	2	6	5112	5117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145218827
118	NC_009337	TCT	2	6	5125	5130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145218827
119	NC_009337	GAAT	2	8	5150	5157	50 %	25 %	25 %	0 %	145218827
120	NC_009337	TGA	2	6	5230	5235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145218827
121	NC_009337	TG	3	6	5408	5413	0 %	50 %	50 %	0 %	145218827
122	NC_009337	CAA	2	6	5416	5421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145218827
123	NC_009337	TTTTA	2	10	5456	5465	20 %	80 %	0 %	0 %	145218827
124	NC_009337	TGT	2	6	5495	5500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145218827
125	NC_009337	TGA	2	6	5527	5532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145218827
126	NC_009337	GTG	2	6	5547	5552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145218827
127	NC_009337	TGA	2	6	5584	5589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145218827
128	NC_009337	TCG	2	6	5622	5627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145218827
129	NC_009337	T	7	7	5641	5647	0 %	100 %	0 %	0 %	145218827
130	NC_009337	TTG	2	6	5676	5681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009337	ATA	2	6	5706	5711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009337	TCC	2	6	5759	5764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145218828
133	NC_009337	T	6	6	5787	5792	0 %	100 %	0 %	0 %	145218828
134	NC_009337	GCA	2	6	5796	5801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145218828
135	NC_009337	A	6	6	5870	5875	100 %	0 %	0 %	0 %	145218828
136	NC_009337	GGAA	2	8	5876	5883	50 %	0 %	50 %	0 %	145218828
137	NC_009337	TCA	2	6	5930	5935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145218828
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262	NC_009337	ACTG	2	8	12082	12089	25 %	25 %	25 %	25 %	145218831
263	NC_009337	GAC	2	6	12143	12148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145218831
264	NC_009337	TCAGC	2	10	12151	12160	20 %	20 %	20 %	40 %	145218831
265	NC_009337	ACA	3	9	12189	12197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145218831
266	NC_009337	AT	3	6	12335	12340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_009337	T	7	7	12353	12359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_009337	AAAC	2	8	12388	12395	75 %	0 %	0 %	25 %	145218832
269	NC_009337	CTT	3	9	12404	12412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145218832
270	NC_009337	CCT	2	6	12427	12432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145218832
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274	NC_009337	GGA	2	6	12682	12687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145218832
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285	NC_009337	CTT	2	6	13080	13085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145218832
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299	NC_009337	GAG	2	6	13895	13900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145218832
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381	NC_009337	ATA	2	6	18468	18473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
382	NC_009337	CGA	2	6	18591	18596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145218836
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387	NC_009337	TCT	2	6	18825	18830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145218836
388	NC_009337	GCG	2	6	18842	18847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145218836
389	NC_009337	CCTTC	2	10	18857	18866	0 %	40 %	0 %	60 %	145218836
390	NC_009337	GTC	2	6	18905	18910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145218837
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393	NC_009337	CAA	2	6	19160	19165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145218837
394	NC_009337	GAGTCC	2	12	19182	19193	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145218837
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